Вторичная очистка применяется в основном при обработке зерна семенного назначения, прошедшего первичную очистку. Полнота выделения примесей при вторичной очистке – не менее 80%. При этом семена должны быть доведены до норм посевного стандарта.
Машины вторичной очистки обрабатывают семена по чистоте до норм 1 и 2 классов за исключением случаев засоренности зернового материала примесями, для выделения которых требуются специальные средства (пневматический сортировальный стол, электромагнитная машина и др.).
В очищенном зерне не должно быть более 1% примесей. Производительность машин задается на пшенице при влажности зерна 15% и засоренности не более 5%. Семенной материал при вторичной очистке разделяют на фракции: очищенные семена, зерновые примеси, аспирационные отходы, крупные примеси. Эффективность очистки – не менее 80%. Потери семян основной культуры допускаются не более 4%, в том числе с аспирационными отходами и крупными примесями – не более 1%.